A coleta de dados através do PNBOIA implica no aperfeiçoamento dos serviços de meteorologia e oceanografia do Brasil. O programa visa contribuir para a caracterização do meio ambiente marinho e prover informações que atendam à segurança da navegação, à previsão meteorológica marinha e à salvaguarda da vida humana no mar, nas áreas marítimas sob responsabilidade do Brasil, gerando informações essenciais para diversos setores estratégicos e contribuindo diretamente para a segurança, a economia e a preservação ambiental.
Descrever e entender a variabilidade e previsibilidade do sistema climático em diferentes escalas espaço-temporais.
Fornecer dados para a previsão numérica de tempo e clima.
Descrever e prever as condições de meteorologia marinha e da superfície do oceano, de forma que qualquer operação no mar possa ser eficiente e segura.
Detectar e avaliar a importância dos efeitos das mudanças climáticas nas condições oceânicas.
Fornecer dados para preservar e restabelecer ecossistemas costeiros e marinhos e para programas de gerenciamento costeiro.
Gerenciar recursos marinhos para o uso sustentável.
Melhorar a previsão e a pronta resposta a catástrofes naturais decorrentes de fenômenos meteorológicos marinhos extremos.