A visão de futuro do IPqM para o horizonte de 2024 a 2027 foi definida como sendo:

“Consolidar-se como Instituição Científica, Tecnológica e de Inovação referência nos campos de pesquisa científica e de desenvolvimento tecnológico nas suas áreas de atuação definidas na Estratégia de Ciência, Tecnologia e Inovação da Marinha, fortalecendo o Poder Marítimo e a expressão científica e tecnológica do Poder Nacional”.