Os valores organizacionais representam os princípios que devem nortear as ações e a conduta dos componentes da força de trabalho de uma Instituição. Os valores adotados pela CPES são os mesmos valores adotados pela MB traduzidos por meio do conjunto dos princípios e costumes expressos na Rosa das Virtudes:

Honra, Lealdade, Iniciativa, Cooperação, Espírito de Sacrifício, Zelo, Coragem, Ordem, Fidelidade, “Fogo Sagrado”, Tenacidade, Decisão, Abnegação,. Espírito Militar, Disciplina e Patriotismo.

Acrescidos dos valores referentes a uma Organização de excelência naquilo que executa, como:

• Administração sempre pautada dentro dos princípios morais e constitucionais da ética, da eficiência e da eficácia;

• Qualificação técnico-profissional e valorização dos recursos humanos;

• Aprimoramento contínuo, buscando sempre inovação para melhoria dos processos;

• Fornecimento de serviços e produtos de alta qualidade;

• Foco no atendimento das necessidades logísticas das Organizações Militares Apoiadas (OMAp); e

• Responsabilidade socioambiental.