O PIRATINI foi incorporado ao serviço da Armada da Marinha Brasileira no dia 30 de novembro de 1970 com o nome de Navio-Patrulha Costeiro "PIRATINI". Porém, em 03 de agosto de 1993, pela Portaria Ministerial No 0489, teve sua denominaçao alterada para Navio-Patrulha Classe "PIRATINI". Desde sua incorporaçao o navio já navegou ao longo da costa do Estado do Pará e por rios e afluentes da Bacia Amazônica e, atualmente, encontra-se operando na Hidrovia Paraguai-Paraná. O PIRATINI é o terceiro navio da história da Marinha Brasileira a ostentar este nome. O primeiro foi a "TORPEDEIRA PIRATINI" (1893-1894) e o segundo foi o "DESTROYER PIRATINI".
O nome "PIRATINI" é homenagem a uma pequena cidade do Rio Grande do Sul, onde, em 06 de novembro de 1836, os "Farrapos" proclamaram a República e a Independencia daquela Província. O vocábulo vem da língua tupi e significa "peixe seco".