A prática da atividade física é essencial para alunos do Colégio Naval não só durante o período de adaptação, mas também em toda sua formação.  Os alunos são avaliados nas atividades de corrida, natação e permanência na água.  Devido ao intenso calor na Cidade de Angra dos Reis, existe a preocupação constante com a reposição de líquidos e de sais minerais.

             Um dos momentos muito esperado pelos adaptandos, é o aprendizado dos movimentos da Ordem Unida, em especial a continência marca registrada da profissão militar, e as regras para a sua realização. A continência é a saudação militar que manifesta respeito e apreço aos seus superiores, pares, subordinados e símbolos, como a bandeira nacional.