O Comando do Corpo de Alunos é departamento do Colégio Naval que administra a rotina e a formação militar dos Alunos. O Comandante do Corpo de Alunos é um oficial no posto de Capitão de Fragata e tem duas divisões subordinadas, a saber, a Divisão de Formação Militar-Naval e o Imediato do Corpo de Alunos (ImCA). Como pode ser visto no organograma abaixo.
De acordo com o Regimento Interno do Colégio Naval, compete ao ComCA:
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dirigir, no que lhe couber, as atividades relacionadas à vida militar e à disciplina do Corpo de Alunos;
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analisar a aptidão para o oficialato, com vistas à seleção de Alunos para ingresso na Escola Naval;
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coordenar e controlar o cumprimento das diretrizes da formação naval-militar aprovadas pelo Comandante;
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dirigir as atividades relacionadas ao treinamento físico-militar e às equipes esportivas representativas dos Alunos, bem como aquelas relacionadas ao treinamento físico-militar da tripulação do CN; e
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assessorar o Comandante nos assuntos relativos à formação militar-naval dos Alunos.