A Escola de Máquinas tem como origem a antiga Escola de Mecânica do CIAW, de onde foi transferida para o Quartel de Marinheiros em janeiro de 1989. Em março do mesmo ano foram iniciados os cursos de especialização e em maio os de aperfeiçoamento. A Escola de Máquinas está instalada nos edifícios 08 e 10 do CIAA. O edifício 08, onde antigamente funcionava a Prefeitura do QM, hoje tem as salas do Encarregado e da Coordenadoria, a Secretaria, a Sala dos Instrutores, a Sala de Projeções "Suboficial Luiz Francisco", o Laboratório de Refrigeração e nove salas de aula com capacidade para 45 alunos cada uma. O edifício 10, onde era a antiga carpintaria, hoje é conhecido como o Galpão de Máquinas. Lá estão instalados os recursos instrucionais utilizados nas aulas práticas dos diferentes cursos bem como o Laboratório de Análises de Água de Caldeiras.