O Centro de Obtenção da Marinha no Rio de Janeiro (COMRJ), estabelecimento de apoio, com sede na cidade do Rio de Janeiro, foi criado pela Portaria nº 0773, de 21 de dezembro de 1993, do Ministro da Marinha.
O COMRJ resultou do desmembramento do Centro de Controle de Estoque da Marinha, criado pelo Decreto nº 37.222, de 27 de abril de 1955, com a denominação de Centro de Controle de Estoque de Material Comum, mais tarde alterada para Centro de Controle de Estoque de Material, pelo Decreto nº 57.040, de 11 de outubro de 1965, em virtude de sua fusão com Centro de Controle de Estoque de Sobressalentes para Navios. Pelo Decreto nº 81.961, de 11 de junho de 1978, sua denominação foi alterada para Centro de Controle de Estoque da Marinha.
O Centro de Controle de Estoque da Marinha foi extinto pelo Decreto nº 1.033, de 30 de dezembro de 1993, ficando as suas atribuições cometidas a duas Organizações Militares criadas dentro da estrutura do Ministério da Marinha: o Centro de Controle de Inventário da Marinha (CCIM) e o Centro de Obtenção da Marinha no Rio de Janeiro (COMRJ).
Em 8 de abril de 1994, o Termo de Ativação foi assinado e o COMRJ iniciou suas atividades de Órgão de Obtenção do Sistema de Abastecimento da Marinha.