O CIAMA tem o propósito de capacitar pessoal para o exercício de cargos e funções operativas e técnicas relacionadas com as atividades de submarino, de mergulho e de operações especiais.

Para consecução deste propósito cabe a ele as seguintes tarefas:
- ministrar cursos, adestramentos e estágios relacionados com as atividades de submarino e mergulho;
- desenvolver estudos e pesquisas de novas técnicas para aplicação na instrução e adestramento; e
- realizar testes e pesquisas hiperbáricas.