Prestar apoio logístico fixo às Forças e unidades navais da Marinha do Brasil que operem nas águas marítima, fluvial ou ribeirinha, sob jurisdição do Comando do 4º Distrito Naval, a fim de contribuir para a defesa da navegação de interesse nacional e para o controle dessas áreas. Para cumprir a missão, a Base Naval de Val de Cães dispõe dos seguintes meios:
» Dique seco Almirante Raul Barros com 225m de comprimento, 25m de boca e 40.000 ton. de capacidade.
» Carreira para embarcações de até 120 ton.
» Oficinas de Máquinas, Mecânica Naval, Estruturas e Metalurgia,Eletricidade, Motores e Refrigeração, Carpintaria e Fundição.
» Grupo de Reparos de Eletrônica e Armamento(GRETARM).
» Guindaste de 12 ton. para apoio aos navios docados.
» Bacia de manobras, Rebocador de porto SCHRAMM, Chata de óleo.
» Píer para atracação de navios com facilidades de apoio.
» Heliponto, permitindo o pouso de todos os helicópteros existentes na Marinha do Brasil.
» Bacia de manobras, Rebocador de porto SCHRAMM, Chata de óleo.