O Programa de Mestrado Profissional em Estudos Marítimos (PPGEM) possui uma infraestrutura de apoio diversificada com salas de aula equipadas com computadores, televisões e projetores; salas de reuniões; 4 auditórios com capacidade de 60 e 550 lugares; Laboratório de Simulações e Cenários (LSC), onde são realizadas videoconferências; e um Centro de Jogos com sistemas nacionais. Possui ainda uma biblioteca com mais de 32 mil títulos disponíveis e possibilidade de acesso a sistemas exógenos de consulta ou empréstimo de títulos, assinatura de periódicos científicos e especializados, além de salas de estudo, equipadas com modernos recursos didáticos.