À Superintendência de Pesquisas compete, especificamente:

 

I - orientar, coordenar e controlar as atividades científicas, tecnológicas ede inovação nas áreas de Oceanografia (Física, Química, Biológica), Geologia e Geofísica Marinhas, Meteorologia, Biotecnologia Marinha, Geoquímica Ambiental, Instrumentação Oceanográfica, Acústica Submarina, Comunicações Submarinas, Sensoriamento Remoto e Engenharias Costeira e Oceânica; e  

II - manter intercâmbio com entidades congêneres com o propósito deacompanhar o estado da arte e a evolução científica e tecnológica na sua área de atuação.