O Departamento de Intendência, com o propósito de alcançar, com eficiência, eficácia, economicidade e efetividade, os objetivos organizacionais, realiza tarefas, cada vez mais desafiadoras, de planejar, organizar, dirigir e controlar atividades e processos para proporcionar o desenvolvimento da EAMES. A EAM-40 tem sob sua subordinação as Divisões de Abastecimento, Finanças, Obtenção e Pagamento. É responsável pelo conforto da tripulação, fornecimento de passagens, realização de licitações e contratos, municiamento, pagamento de pessoal militar, distribuição de fardamento e controle patrimonial e financeiro da Escola.
