A DHN, no cumprimento de sua missão, promove a realização de Cursos do Sistema Ensino Naval que lhe competem e supervisiona a participação do pessoal da Marinha nos eventos sob a sua orientação técnica, tais como conclaves, intercâmbios, estágios e demais cursos. Por meio da Superintendência de Ensino, além dos Cursos Expeditos e Estágios de Qualificação, ministra o Curso de Aperfeiçoamento de Hidrografia para Oficiais, bem como os Cursos de Aperfeiçoamento e Especialização de Faroleiros e em Hidrografia e Navegação para Praças. No âmbito da Organização Hidrográfica Internacional (OHI), os Cursos de Aperfeiçoamento de Hidrografia para Oficiais e de Aperfeiçoamento em Hidrografia e Navegação para Praças são reconhecidos como categoria “A” e “B”, respectivamente, o que atesta a excelência da qualidade dos cursos ministrados nesta Diretoria. Desta maneira, a DHN apoia a aplicação do Poder Naval, qualificando militares e civis da Marinha do Brasil e extra-Marinha para o correto desempenho das funções técnicas e administrativas nas áreas de Hidrografia, Navegação, Oceanografia, Cartografia, Meteorologia e Sinalização Náutica.