Área de jurisdição do 6º Distrito Naval abrange os Estados do Mato Grosso e Mato Grosso do Sul. Estes dois estados, emancipados desde 1978, guardam entre si características bastantes distintas: o Mato Grosso tem configuração de uma "pré-amazônia"; já, no Mato Grosso do Sul, localiza-se uma extensa planície, com características próprias e uma área de 130.000 Km² (correspondente a três estados do Rio de Janeiro), conhecida como Pantanal.

Com a emancipação dos dois estados, a cidade de Ladário passou a pertencer ao Estado do Mato Grosso do Sul.